Döner Sermaye Mali Yönetim Sistemi (DMİS), Hazine ve Maliye Bakanlığı Muhasebat Genel Müdürlüğünce uygulamaya alınmış genel olarak düzgün çalışmaktadır. DMİS sistemi muhasebe işlemlerinin kontrolünü sağlamaktadır. DMİS sisteminde tespit edilen sorunlar kısaca aşağıda sıralanmıştır:

1. HBYS sisteminde verilerin anlık olarak DMİS sistemine aktarılmadığı için üç aya kadar gecikmeli verilmesi nedeniyle işlemlerin kontrolü sağlanamamaktadır.

2. 700’lü gider hesapları ile gelirlerin gider yerlerine/gelir birimlerine göre ayrımı yapılamadığı için maliyet kontrolü muhasebe sistemi üzerinden kontrol edilememektedir.

3. DMİS sisteminin kontrolü ve kayıt işlemleri Saymanlık üzerinden yapılmakta bu nedenle HBYS sistemine kayıtlarda muhasebe işlemlerinin takibi imkansız olarak devam etmektedir

4. 120, 121, 128 ve 320 nolu hesaplarda yapılan kısmi tahsilat ve ödemelerde kısmi tahsilat ve ödeme yapılamadığından, yeniden tahakkuk işlemi yapılması sonucu, mizan kayıtlarının olması gerekenden fazla görünmesine sebep olmaktadır.